IP.Board использует другой фреймворк — Prototype.
jQuery — это совершенно другой фреймворк, это равноценно попытке запустить одновременно и Windows и Linux (только не надо про виртуальные машины шутить, я серьезно).
Если вы подключите jQuery, то ничего работать не будет.
Все скрипты требующие jQuery несовместимы с IP.Board.
Сделать возможным подключение jQuery в IP.Board невозможно. IPS не собирается переписывать весь front-end под jQuery, IP.Board — целостная система, что предполагает, что никто вообще не будет пытаться что либо делать с кодом напрямую, это же касается и шаблонов с JS кодом.
Единственный вариант — искать аналоги скрипта под Prototype или переписывать его вручную.