Можно проверить, что вы делаете, заглянув в \IPS\Data\Store::i()->cacheKeys
Если кеш очищен, там будет пустой массив.
Вы бы объяснили, для чего это делаете и что хотите получить. Первая строка чистит кеш для гостей, вторая вообще к приложениям отношения не имеет, это хранение темплейтов и прочего внутреннего хлама.
Можете еще попробовать \IPS\Output\Cache::i()->clearAll()