Делаем бэк ап и пробуем, все должно идти норм, я давно обновлял 3,4,6 на 4,3,8 вроде, полет был нормальный без багов.
С IPB давно не обновлял, пробуем тестим, отписываем.
Залить файлы с заменой старых и перейти по адресу admin/upgrade
Чтобы не терять никаких данных нужно делать бэкап файлов и базы при любых действиях с сайтом.