Ну тянет такие пакеты, которые поддерживает ОС. Точнее те, которые считаются стабильными для этой ОС.
Я с 2015 года использую MariaDB, у меня очень много баз данных с которыми работают базы данных, боты и различного рода другие скрипты. Никогда особых проблем не было. Да, они возникают, если не тюнить конфиг. Но тут и понимать надо, что на дефолтном конфиге ты далеко не уедешь.
Что сейчас нравится в ISPmanager 6, то что можно в докере поднять любую версию MySQL, в том числе MariaDB и использовать сразу несколько серверов, как альтернатива с версиями PHP. Раньше, когда такого не было, то приходилось костылить, что было чревато тем, что панель ломалась.