Я не использую панели.
Мой способ установки был таким:
Удаление PHP5 и Apache2 (с сохранением конфигов сайтов)
Удаление репозитория PHP5 из системы
Добавление репозитория PHP7.0
Обновление списка пакетов
Установка Apache2, PHP7.0 и дополнительных пакетов из репозитория PHP7.0
Для того, чтобы заставить NGINX работать с PHP7.0, php7.0-fpm и nginx нужно правильно настроить, чтобы они слушали один и тот же сокет или один и тот же порт.